Tag: PyMOL
Alinhamento de estruturas 3D com PyMOL
Reading Time: 8 minutes PyMOL fornece diversos métodos para alinhamento estrutural de moléculas tanto por meio de sua interface simplificada quanto por meio de seu terminal de linhas comando. Para compreender como ele funciona na prática, vamos apresentar a seguir, uma série de estudos de caso utilizando-o para realizar alinhamentos de estruturas. Estudo de caso…
Selecionando partes de uma proteína com PyMOL (comando select)
Reading Time: 3 minutes O comando select pode ser usado no terminal de comandos do PyMOL para selecionar resíduos ou grupos de resíduos. Sintaxe: select [o que se deseja selecionar] Há várias palavras-chave que podem ser usadas na seleção, como por exemplo: resi: seleção com base no número do resíduo (e.g., select resi 20); resname:…
Alinhamentos estruturais
Reading Time: 11 minutes Conheça os métodos de sobreposição de estruturas de macromoléculas
Alinhando estruturas por linha de comando com PyMOL
Reading Time: 3 minutes PyMOL é uma ferramenta de visualização de moléculas com uma grande quantidade de recursos em sua interface. Dentre esses recursos, se encontra o painel do terminal de linha de comandos. Por meio desse terminal é possível realizar inúmeras análises, como por exemplo, alinhamento de estruturas. Esse tipo de alinhamento pode ser…
