Categoria: Bioinformática estrutural
Alinhamentos híbridos com PROMALS3D
Reading Time: 2 minutes Ao acessar a página do PROMALS3D, o usuário encontrará a seguinte interface (Figura 37). PROMALS3D permite usar como entrada sequências no formato FASTA. Opcionalmente, o usuário pode utilizar como entrada arquivos de estruturas de proteínas ou apenas informar o código identificador no PDB. Para executar, basta clicar no botão “Submit”. Após…
Alinhamento de estruturas 3D com o software MUSTANG
Reading Time: 3 minutes MUSTANG (MUltiple protein STructural AligNment alGorithm) [10] é um software desenvolvido para realizar alinhamento estrutural múltiplo de proteínas (Figura 33). Possui código-aberto desenvolvido em C++. Sua estratégia de alinhamento sobrepõe as estruturas a partir das posições espaciais dos carbonos alfa (Cα) dos aminoácidos. O seu algoritmo utiliza uma heurística progressiva em…
