Autor: admin
Dinâmica molecular: como mostrar um filme completo em uma folha de papel?
Reading Time: 13 minutes Compreender como as moléculas se comportam pode ser essencial para desvendar seus mecanismos de atuação, o que pode ter diversas utilidades no campo da biologia, como por exemplo, descoberta de novos medicamentos e outros produtos biotecnológicos. Quando falamos sobre comportamento e mecanismo de ação de uma molécula, estamos nos referindo a…
Docagem molecular: em busca do encaixe perfeito e acessível
Reading Time: 8 minutes Docagem molecular é um dos métodos mais populares da modelagem molecular. Essa técnica computacional visa buscar “o encaixe perfeito” entre duas moléculas simulando assim o processo de reconhecimento molecular. A partir da predição de orientação, forma-se um complexo que pode ser usado para estimar a afinidade de ligação ou a força…
Tipos de cobertura em sequenciamento genômico
Reading Time: 6 minutes Cobertura é um conceito bastante citado quando se trata de sequenciamento de genomas. Dependendo do contexto, o conceito de cobertura pode ter diferentes significados, o que pode gerar um pouco de confusão. Neste artigo, serão apresentadas terminologias para diferenciar os dois tipos de cobertura: vertical e horizontal. Revisão: BIOINFO – Revista…
BIOINFO, v.1, 2021
Reading Time: 2 minutes BIOINFO #01 – Primeira edição da Revista Brasileira de Bioinformátia e Biologia Computacional. BIOINFO – Revista Brasileira de Bioinformática Edição #. . DOI: ISBN: Organização Revisão Publicação Alfahelix Editora Sumário Editorial Bioinformática clássica 1. Como começar na Bioinformática (BIOINFO, v.1, 2021, artigo n.1). 2. Biologia e Computação: Um Casamento Perfeito (BIOINFO,…
Introdução aos bancos de dados biológicos
Reading Time: 10 minutes O conhecimento biológico é armazenado através de bancos de dados. O fundamento mais importante para a bioinformática aplicada é a coleta de dados de sequência e suas informações biológicas associadas. Revisão: BIOINFO – Revista Brasileira de Bioinformática. Edição #. . DOI: O conhecimento biológico é armazenado através de bancos de dados.…
Vias biológicas
Reading Time: 11 minutes Uma via biológica é uma anotação de um conjunto de interações moleculares ocorrendo dentro de um sistema biológico. Sistema biológico pode se referir a uma célula, um tecido, um órgão ou, até mesmo, o organismo como um todo. As vias são compostas por entidades biológicas, que podem ser genes, enzimas, metabólitos,…
Métricas de avaliação em machine learning
Reading Time: 8 minutes Neste artigo, veremos as principais métricas para avaliação de modelos de classificação de dados, como acurácia, sensibilidade (recall ou revocação), especificidade, precisão e F-score. Revisão: BIOINFO – Revista Brasileira de Bioinformática. Edição #. . DOI: Ao construir um classificador usando machine learning, um desenvolvedor deve se perguntar o quão bom é…
Uma estratégia para engajamento de participantes de eventos online
Reading Time: 12 minutes Aqui, é apresentada uma estratégia de gamificação usada para ampliar o engajamento dos participantes durante o I Workshop Online de Bioinformática (WOB20). A estratégia, denominada “Taça das Casas”, consistiu em agrupar os participantes, com base em suas áreas de interesse, em quatro grupos distintos que competiram entre si. Revisão: BIOINFO –…
Sequenciamento NGS: Status e Perspectivas
Reading Time: 16 minutes Next Generation Sequencing (NGS), ou Sequenciamento de nova Geração são o conjunto de técnicas de Biologia Molecular e Bioinformática utilizadas para obter a sequência de ácidos nucleicos de uma amostra biológica. A utilização dessas técnicas vêm crescendo vertiginosamente desde a sua criação, quinze anos atrás, e se expande por várias áreas…
Imunobioinformática para leigos
Reading Time: 21 minutes Neste artigo, vamos falar sobre imunobioinformática. Você sabe o que é isso? Já ouviu falar sobre? Pois bem, como o nome sugere a imunobioinformática é sim a junção dos vastos conhecimentos da imunologia com a prática de estratégias de bioinformática. Ou também pode ser entendida como a aplicação das diversas ferramentas…